Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms