Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBG9

SYNPR, Synaptoporin, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPRQ8TBG9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPRQ8TBG9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms