Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms