Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL11Q8NHH1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms