Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms