Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z9

LMNTD1, Lamin tail domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD1Q8N9Z9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMNTD1Q8N9Z9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms