Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTBP4Q8N2S1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
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