Protein–RNA interactions for Protein: Q86Z20

CCDC125, Coiled-coil domain-containing protein 125, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC125Q86Z20 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC125Q86Z20 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC125Q86Z20 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC125Q86Z20 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC125Q86Z20 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC125Q86Z20 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC125Q86Z20 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC125Q86Z20 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC125Q86Z20 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC125Q86Z20 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC125Q86Z20 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC125Q86Z20 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC125Q86Z20 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC125Q86Z20 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC125Q86Z20 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC125Q86Z20 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC125Q86Z20 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC125Q86Z20 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC125Q86Z20 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC125Q86Z20 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC125Q86Z20 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC125Q86Z20 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC125Q86Z20 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC125Q86Z20 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC125Q86Z20 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms