Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms