Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms