Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms