Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms