Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRCQ7RTU9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms