Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms