Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDC4Q6P2E9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms