Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDD2Q6NTF9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDD2Q6NTF9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDD2Q6NTF9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDD2Q6NTF9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDD2Q6NTF9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDD2Q6NTF9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDD2Q6NTF9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDD2Q6NTF9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDD2Q6NTF9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDD2Q6NTF9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDD2Q6NTF9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDD2Q6NTF9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDD2Q6NTF9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDD2Q6NTF9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDD2Q6NTF9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDD2Q6NTF9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDD2Q6NTF9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms