Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 999 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCTP1Q6DN14 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
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