Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms