Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms