Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms