Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms