Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms