Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms