Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms