Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00303Q3SY05 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms