Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms