Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms