Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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