Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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