Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms