Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms