Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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