Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 ATP5C1-206ENST00000465936 292 ntTSL 317.54■□□□□ 0.46e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.296e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.246e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 PLOD3-207ENST00000456079 563 ntTSL 416.4■□□□□ 0.226e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 ARL6IP1-208ENST00000569976 778 ntTSL 216.24■□□□□ 0.196e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 PNCK-214ENST00000439087 754 ntTSL 516.16■□□□□ 0.186e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 PNCK-232ENST00000489536 836 ntTSL 216.12■□□□□ 0.176e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 PNCK-211ENST00000433470 717 ntTSL 515.74■□□□□ 0.116e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.016e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 ATP5C1-204ENST00000460820 622 ntTSL 212.8□□□□□ -0.366e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 PNCK-205ENST00000411968 557 ntTSL 510.75□□□□□ -0.696e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 POM121C-201ENST00000398379 715 ntTSL 29.48□□□□□ -0.896e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 ARL6IP1-204ENST00000562819 578 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.096e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.26e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 ARL6IP1-205ENST00000563861 948 ntTSL 1 (best)6.92□□□□□ -1.36e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 ATP5C1-208ENST00000473809 530 ntTSL 25.05□□□□□ -1.66e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 C2-210ENST00000468407 694 ntTSL 212.31□□□□□ -0.448e-10■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 C2-215ENST00000486124 2800 ntTSL 510.56□□□□□ -0.728e-10■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.434e-62■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.344e-62■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.264e-62■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.773e-9■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.743e-9■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.723e-9■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.043e-9■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.63e-9■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.731e-14■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 MIF-203ENST00000498385 435 ntTSL 222.43■■□□□ 1.185e-7■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 GPI-216ENST00000592144 678 ntTSL 320.14■□□□□ 0.815e-7■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 HNRNPK-206ENST00000457156 1283 ntTSL 520.01■□□□□ 0.795e-7■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 MIF-202ENST00000465752 589 ntTSL 1 (best)19.38■□□□□ 0.691e-14■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.665e-7■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 GPI-214ENST00000590375 529 ntTSL 419.13■□□□□ 0.655e-7■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 GPI-211ENST00000589640 571 ntTSL 419.13■□□□□ 0.655e-7■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 GPI-209ENST00000589399 565 ntTSL 519.06■□□□□ 0.645e-7■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.221e-14■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.075e-7■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 GPI-215ENST00000591204 559 ntTSL 49.85□□□□□ -0.835e-7■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 HNRNPK-201ENST00000351839 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.915e-7■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 HNRNPK-205ENST00000376281 2928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.025e-7■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.296e-7■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 BSDC1-206ENST00000455895 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.386e-7■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 BSDC1-204ENST00000444377 2925 ntTSL 1 (best)10.69□□□□□ -0.76e-7■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.277e-9■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 ADD1-223ENST00000538860 507 ntTSL 316.53■□□□□ 0.247e-9■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.187e-9■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.157e-9■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.047e-9■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 ADD1-210ENST00000503455 3206 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.487e-9■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 ADD1-206ENST00000398129 3787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.617e-9■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 ADD1-217ENST00000513328 3107 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.677e-9■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 ADD1-218ENST00000513762 3581 ntTSL 310.47□□□□□ -0.737e-9■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.211e-11■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.341e-12■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.561e-7■□□□□ 11.2
PCBP1Q15365 PLK1-203ENST00000562407 540 ntTSL 212.28□□□□□ -0.442e-6■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 OBSL1-209ENST00000465589 571 ntTSL 321.38■■□□□ 1.011e-8■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 OBSL1-212ENST00000491370 584 ntTSL 420.48■□□□□ 0.871e-8■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 PTBP1-206ENST00000585856 1217 ntTSL 229.67■■■□□ 2.341e-13■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 STRN3-207ENST00000555358 2208 ntTSL 1 (best)24.69■■□□□ 1.541e-6■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.169e-7■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.129e-7■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 EML4-208ENST00000482660 584 ntTSL 419.76■□□□□ 0.751e-6■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 EML4-205ENST00000409040 962 ntTSL 1 (best)18.88■□□□□ 0.611e-6■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.541e-6■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.319e-7■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.132e-10■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 ARL2-203ENST00000529254 601 nt15.88■□□□□ 0.139e-7■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 ESPN-209ENST00000477679 885 ntTSL 215.59■□□□□ 0.091e-6■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.05■□□□□ -01e-6■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.031e-6■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 GDI2-206ENST00000456041 918 ntTSL 513.26□□□□□ -0.292e-10■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 GDI2-209ENST00000609712 622 ntTSL 313.14□□□□□ -0.312e-10■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 GDI2-204ENST00000418688 636 ntTSL 512.58□□□□□ -0.42e-10■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 GDI2-202ENST00000380181 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.42e-10■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 ARL2-206ENST00000533729 795 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.449e-7■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.481e-6■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 RNASET2-209ENST00000499370 2164 ntTSL 210.93□□□□□ -0.665e-7■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 GDI2-201ENST00000380127 584 ntTSL 39.95□□□□□ -0.822e-10■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 GDI2-208ENST00000608581 634 ntTSL 39.6□□□□□ -0.872e-10■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 FARP1-202ENST00000376581 1021 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.921e-6■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.061e-6■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 MAGED1-205ENST00000470461 810 ntTSL 26.76□□□□□ -1.331e-6■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 MLLT6-206ENST00000615858 1208 ntTSL 412.57□□□□□ -0.41e-8■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.62e-11■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 FKBP10-206ENST00000489591 2826 ntTSL 217.1■□□□□ 0.332e-11■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 FKBP10-203ENST00000455106 1965 ntTSL 215.35■□□□□ 0.052e-11■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 PPHLN1-202ENST00000317560 1359 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.136e-7■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.776e-7■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.833e-16■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.623e-16■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.573e-16■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.43e-16■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 NMU-206ENST00000515325 616 ntTSL 36.97□□□□□ -1.293e-16■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.131e-8■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.351e-6■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.229e-9■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 VPS72-202ENST00000368892 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)22.6■■□□□ 1.211e-12■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 VPS72-201ENST00000354473 1347 ntTSL 320.84■□□□□ 0.931e-12■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 VPS72-205ENST00000491094 4267 ntTSL 511.02□□□□□ -0.651e-12■□□□□ 11.1
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