Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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