Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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