Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
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