Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
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