Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NWD1Q149M9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NWD1Q149M9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NWD1Q149M9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NWD1Q149M9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NWD1Q149M9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NWD1Q149M9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NWD1Q149M9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NWD1Q149M9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NWD1Q149M9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NWD1Q149M9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NWD1Q149M9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms