Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms