Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
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