Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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