Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
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