Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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