Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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CUL3Q13618 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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CUL3Q13618 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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CUL3Q13618 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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CUL3Q13618 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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CUL3Q13618 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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