Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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