Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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