Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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