Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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SP140Q13342 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SP140Q13342 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SP140Q13342 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SP140Q13342 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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SP140Q13342 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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SP140Q13342 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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SP140Q13342 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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SP140Q13342 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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SP140Q13342 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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SP140Q13342 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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SP140Q13342 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SP140Q13342 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SP140Q13342 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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SP140Q13342 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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SP140Q13342 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SP140Q13342 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SP140Q13342 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SP140Q13342 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SP140Q13342 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SP140Q13342 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SP140Q13342 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SP140Q13342 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SP140Q13342 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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