Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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