Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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